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マクドナルド「日本回想記」 : インディアンの見た幕末の日本 / マクドナルド[著] ; ウィリアム・ルイス, 村上直次郎編 ; 富田虎男訳訂
再訂版. - 東京 : 刀水書房 , 2012.9
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荷蘭時代台灣史論文集 / 村上直次郎 [ほか] 著 ; 許賢瑶譯
精裝. - 宜蘭 : 佛光人文社會學院 , 2001.6
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日本回想記 : インディアンの見た幕末の日本 / マクドナルド著 ; ウィリアム・ルイス, 村上直次郎編 ; 富田虎男訳訂
補訂版. - 東京 : 刀水書房 , 1981.7
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Letters written by the English residents in Japan, 1611-1623 : with other documents on the English trading settlement in Japan in the seventeenth century / edited by N. Murakami and K. Murakawa
[Tenri] : [Tenri Central Library]. - [Tokyo] : [Sold by Yushodo Booksellers] , [1973]
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バタヴィア城日誌 / 村上直次郎訳注 ; 中村孝志校注
1,2,3. - 東京 : 平凡社 , 1970.9-1975.5
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イエズス会日本年報 / イエズス会 [編] ; 村上直次郎訳 ; 柳谷武夫編輯
上,下. - 東京 : 雄松堂書店 , 1969.5-1969.11
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イエズス会士日本通信 / イエズス会 [編] ; 村上直次郎訳 ; 柳谷武夫編輯
上,下. - 東京 : 雄松堂書店 , 1968.12-1969.2
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耶蘇會士日本通信 / 村上直次郎訳 ; 渡辺世祐註
上,下. - 改訂復刻版. - 東京 : 雄松堂書店 , 1966.9
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ドン・ロドリゴ日本見聞録 ; ビスカイノ金銀島探検報告 / 村上直次郎譯註
改訂復刻版. - 東京 : 雄松堂書店 , 1966.9
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異國往復書翰集 ; 増訂異國日記抄 / 村上直次郎訳註
改訂復刻版. - 東京 : 雄松堂書店 , 1966.9
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皇帝ネロ / タキトウス著 ; 国原吉之助訳 . 山田長政 / エレミヤス・ファン・フリート著 ; 村上直次郎訳 . ラスプーチン / フュレープ=ミラー著 ; 酒井只男訳 . 黒シャツ党のローマ進軍 / アンドレ・ファルク著 ; 山上正太郎訳
東京 : 筑摩書房 , 1962.5
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長崎オランダ商館の日記 / 村上直次郎譯
第1輯,第2輯,第3輯. - 東京 : 岩波書店 , 1956-1958
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日本と比律賓 / 村上直次郎著
東京 : 朝日新聞社 , 1945.7
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耶蘇会の日本年報 / 耶蘇会編 ; 村上直次郎訳注
第1輯,第2輯. - 東京 : 拓文堂 , 1943-
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南方文化講座 / 村上直次郎 [ほか] 執筆 ; 三省堂南方文化講座刊行係編
民族と民族運動篇,歴史篇,日本南方發展史篇. - 東京 : 三省堂 , 1943-1944
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六昆王山田長政 / 村上直次郎著
東京 : 朝日新聞社 , 1942.4
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日本と葡萄牙 / 村上直次郎著 ; [日葡協會編]
東京 : 改造社 , 1942.4
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蘭領印度史 / A.J. エイクマン, F.W. スターペル共著 ; 村上直次郎, 原徹郎共譯
東京 : 東亞研究所 , 1942.1
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ドン・ロドリゴ日本見聞録 ; ビスカイノ金銀島探檢報告 / 村上直次郎譯註
東京 : 奥川書房 , 1941.12
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Kirishito-ki und Sayo-yoroku : japanische Dokumente zur Missionsgeschichte des 17. Jahrhunderts / ins Deutsche übertragen von Gustav Voss und Hubert Cieslik ; mit einem Vorwort von Naojiro Murakami
Tokyo : Sophia University , 1940
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出島蘭館日誌 / オランダ東インド会社長崎商館編 ; 村上直次郎訳
上巻,中巻,下巻. - 東京 : 文明協会 , 1938-1939
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抄譯バタビヤ城日誌 / 村上直次郎譯註
上巻,中巻. - 東京 : 日蘭交通史料研究会 , 1937.1-
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| 23 |
耶蘇會士日本通信 / 村上直次郎譯註
豊後篇 上巻,豊後篇 下巻. - 東京 : 帝國教育會出版部 , 1936.5-1936.9
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吉利支丹宗門の興廢 / 村上直次郎[著]
東京 : 岩波書店 , 1935.2
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| 25 |
臺灣文化史説
[正],續. - [台北] : 臺灣文化三百年記念會 , 1930.10-1931.3
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| 26 |
The bilingual Formosan manuscripts / by N. Murakami
Taihoku : [s. n.] , 1930
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異國往復書翰集 ; 増訂異國日記抄 / 村上直次郎訳註
東京 : 駿南社 , 1929.10
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ドン・ロドリゴ日本見聞録 ; ビスカイノ金銀島探検報告 / 村上直次郎譯註
東京 : 駿南社 , 1929.4
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耶蘇會士日本通信 / 村上直次郎訳 ; 渡辺世祐註
上,下. - 東京 : 駿南社 , 1927-1928
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耶蘇會年報 / [村上直次郎譯]
上巻. - [長崎] : 長崎市役所 , 1926
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| 31 |
貿易史上の平戸 / 村上直次郎著
東京 : 日本学術普及会 , 1917.4
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日蘭三百年の親交 / 村上直次郎著
訂正再版. - 東京 : 冨山房 , 1915.9
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日本と和蘭 / 日蘭協会編輯部編
東京 : 日蘭協会 , 1914
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日蘭三百年の親交 / 村上直次郎著
[東京] : 村上直次郎 , 1914
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異國日記抄 / 村上直次郎校註
東京 : 島連太郎. - 東京 : 三秀舎(印刷) , 1911.3
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Letters written by the English residents in Japan, 1611-1623 : with other documents on the English trading settlement in Japan in the seventeenth century / edited by N. Murakami and K. Murakawa
Tôkyô : Sankôsha , 1900
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Diary of Richard Cocks : cape-merchant in the English factory in Japan, 1615-1622 : with correspondence
v. 1,v. 2. - Japanese ed. / with additional notes by N. Murakami. - Tōkyō : Sankōsha , 1899
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